대한민국이 AI 3대 강국 도약을 국가 전략으로 천명한 가운데, 국세청이 2025년 10월 27일부터 시행하는 AI 중소기업 세무조사 제외·유예 및 세정지원 방안을 발표했습니다. 본 글에서는 정책 핵심 내용을 쉽게 정리하고, 왜 이것이 AI 기업의 성장에 실질적 도움이 되는지, 현장에서 체감할 실무 포인트까지 짚어드리겠습니다.
1) 이번 조치의 핵심: “세무 리스크 최소화 → 연구·개발 및 사업화에 자원 집중”
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대상: 중기부·관련 협회 협조로 선정된 AI 스타트업 등 약 4,800개 중소기업
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세무검증 최소화
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창업 5년 이내 AI 스타트업: 정기 세무조사 제외
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그 외 AI 중소기업: 정기 세무조사 최대 2년 유예
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명백한 탈루 혐의 없음 시, 신고내용확인 제외
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R&D·세액공제 신속 처리
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연구·인력개발비 세액공제 사전심사 우선 처리
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법인세 공제·감면 컨설팅 우선 처리
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유동성 지원
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납부기한 연장, 납세담보 면제, 압류·매각 유예
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경정청구 우선 처리, 환급금 조기 지급
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전용 상담 채널
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홈택스 전용상담 서비스
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전국 세무서 AI 기업 전용상담창구 설치
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추가 세제 확대(예정)
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생성형 AI 등 5개 세부기술을 연구·인력개발비세액공제 국가전략기술로,
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AI 데이터센터를 통합투자세액공제 사업화시설로 지정 추진
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관련 법령 개정 완료 시 2025.1.1. 이후 발생분에 대해 세제혜택 대폭 확대
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2) 왜 중요한가: 미래산업 전략의 디테일이 정책 성패를 가릅니다.
AI는 인재·연구개발·데이터 인프라가 맞물려야만 경쟁우위를 확보할 수 있는 산업입니다. 이번 조치는 단순한 납세편의가 아니라, 세무 리스크와 행정부담을 완화해 기업이 코어 역량(모델 고도화, 제품 출시, 글로벌 진출)에 집중하도록 설계된 디테일한 시행 정책입니다.
이는 “AI 강국”이라는 국가 비전을 기업이 체감 가능한 수준으로 연결하는 실행의 신호라 평가합니다.
3) 현장에서 본 세무조사의 현실: 본업에 미치는 영향은 상상 이상입니다
실무에서 세무조사에 착수하면 기업은 다음과 같은 부담을 겪게 됩니다.
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회계·세무 인력의 장기 투입 및 야근 상시화: 결산자료, 세액계산 근거, 매출·원가 증빙, 계약서류 등 방대한 자료를 단기간에 정리·제출해야 합니다.
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조사팀의 서류 열람 및 반출 대응: 사본 제출, 추가 소명, 보완 질의가 반복되며, 조사기간동안 정기 및 비정기적인 경영진·실무자 인터뷰가 이어집니다.
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광범위한 사내 리소스 분산: 재무팀뿐 아니라 영업, 구매, 개발, 심지어 운영 조직까지 증빙·소명에 동원됩니다.
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프로젝트 일정 지연: 주요 릴리즈, 투자 유치, 대형 고객 온보딩이 영향을 받기 쉽습니다.
AI 산업은 스피드와 타이밍이 경쟁력입니다. 이번 정기 세무조사 제외·유예는 기업이 본업에 전념할 골든타임을 제공한다는 점에서 실질적이고 강력한 성장 촉진책입니다.
4) 세정지원 체크리스트
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우리 회사가 선정된 세정지원 대상(약 4,800개) 해당하는지 여부 확인
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R&D 세액공제 전략 정비
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사전심사를 조속히 신청하여 현금흐름 예측을 명확화
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프로젝트별 개발계획서·인력투입 기록·기술문서·비용증빙 체계 표준화
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환급·연장 제도 활용
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납부기한 연장, 환급금 조기 지급, 경정청구 우선 처리 등 유동성 수단을 적극 검토
전용상담 채널 활용(홈택스 126 또는 전문 세무사/회계사 등)
맺음말: “AI 강국의 길, 디테일한 실행이 만듭니다”
이번 국세청의 세무조사 제외·유예와 세정지원은 AI 기업이 연구개발과 스케일업에 집중하도록 돕는 실행형 정책입니다. 대한민국이 AI 강국으로 도약하려면 정책의 방향성뿐 아니라 현장에서의 체감이 중요합니다. 그런 점에서 이번 조치는 정책의 디테일이 성장을 견인할 수 있음을 보여주는 사례입니다.
AI 중소기업 여러분, 지금이 본업에 집중할 시간입니다. 필요하시면 다음과 같은 부분을 실무적으로 지원해 드리겠습니다.
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연구·인력개발비 세액공제 사전심사 준비와 증빙 체계 구축
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환급·연장·경정청구 등 유동성 확보 전략 컨설팅
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세무조사 사전 대비 자료 표준화·내부 컨트롤 정비
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AI 데이터센터·국가전략기술 지정 대비 투자·회계 구조 설계
솔리드행정사는 기업이 세정 리스크를 최소화하고 성장에 집중할 수 있도록 끝까지 함께하겠습니다.
문의: 솔리드행정사 대표 행정사 박종국
Email: solidpark808@gmail.com
Website: www.solidpark.co.kr
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